Il funzionamento delle pompe a tubo flessibile GERTEC si basa sul principio della mandata peristaltica, ovvero la capacità del tubo flessibile della pompa di tornare nella forma iniziale dopo ogni compressione. Quando il rullo rotante di compressione comprime il tubo muovendosi su di esso, il lato aspirazione e il lato mandata non sono collegati. La risalita del tubo dopo ogni compressione crea una cavità che provoca un'aspirazione del liquido di mandata. Contemporaneamente, quest'ultimo viene espulso dal tubo sul lato di mandata.